Add more options for distribution charts
Changing title, color, tick format, and domain
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parent
934608d971
commit
0c66bb0579
|
@ -5,18 +5,15 @@ import {
|
||||||
distributionError,
|
distributionError,
|
||||||
distributionErrorToString,
|
distributionErrorToString,
|
||||||
} from "@quri/squiggle-lang";
|
} from "@quri/squiggle-lang";
|
||||||
import { Vega, VisualizationSpec } from "react-vega";
|
import { Vega } from "react-vega";
|
||||||
import * as chartSpecification from "../vega-specs/spec-distributions.json";
|
|
||||||
import { ErrorAlert } from "./Alert";
|
import { ErrorAlert } from "./Alert";
|
||||||
import { useSize } from "react-use";
|
import { useSize } from "react-use";
|
||||||
import clsx from "clsx";
|
import clsx from "clsx";
|
||||||
|
|
||||||
import {
|
import {
|
||||||
linearXScale,
|
buildVegaSpec,
|
||||||
logXScale,
|
DistributionChartSpecOptions,
|
||||||
linearYScale,
|
} from "../lib/distributionSpecBuilder";
|
||||||
expYScale,
|
|
||||||
} from "./DistributionVegaScales";
|
|
||||||
import { NumberShower } from "./NumberShower";
|
import { NumberShower } from "./NumberShower";
|
||||||
|
|
||||||
export type DistributionPlottingSettings = {
|
export type DistributionPlottingSettings = {
|
||||||
|
@ -24,19 +21,17 @@ export type DistributionPlottingSettings = {
|
||||||
showSummary: boolean;
|
showSummary: boolean;
|
||||||
/** Whether to show the user graph controls (scale etc) */
|
/** Whether to show the user graph controls (scale etc) */
|
||||||
showControls: boolean;
|
showControls: boolean;
|
||||||
/** Set the x scale to be logarithmic by deault */
|
} & DistributionChartSpecOptions;
|
||||||
logX: boolean;
|
|
||||||
/** Set the y scale to be exponential by deault */
|
|
||||||
expY: boolean;
|
|
||||||
};
|
|
||||||
|
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||||||
export type DistributionChartProps = {
|
export type DistributionChartProps = {
|
||||||
distribution: Distribution;
|
distribution: Distribution;
|
||||||
width?: number;
|
width?: number;
|
||||||
height: number;
|
height: number;
|
||||||
|
actions?: boolean;
|
||||||
} & DistributionPlottingSettings;
|
} & DistributionPlottingSettings;
|
||||||
|
|
||||||
export const DistributionChart: React.FC<DistributionChartProps> = ({
|
export const DistributionChart: React.FC<DistributionChartProps> = (props) => {
|
||||||
|
const {
|
||||||
distribution,
|
distribution,
|
||||||
height,
|
height,
|
||||||
showSummary,
|
showSummary,
|
||||||
|
@ -44,7 +39,8 @@ export const DistributionChart: React.FC<DistributionChartProps> = ({
|
||||||
showControls,
|
showControls,
|
||||||
logX,
|
logX,
|
||||||
expY,
|
expY,
|
||||||
}) => {
|
actions = false,
|
||||||
|
} = props;
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||||||
const [isLogX, setLogX] = React.useState(logX);
|
const [isLogX, setLogX] = React.useState(logX);
|
||||||
const [isExpY, setExpY] = React.useState(expY);
|
const [isExpY, setExpY] = React.useState(expY);
|
||||||
|
|
||||||
|
@ -64,7 +60,7 @@ export const DistributionChart: React.FC<DistributionChartProps> = ({
|
||||||
const massBelow0 =
|
const massBelow0 =
|
||||||
shape.value.continuous.some((x) => x.x <= 0) ||
|
shape.value.continuous.some((x) => x.x <= 0) ||
|
||||||
shape.value.discrete.some((x) => x.x <= 0);
|
shape.value.discrete.some((x) => x.x <= 0);
|
||||||
const spec = buildVegaSpec(isLogX, isExpY);
|
const spec = buildVegaSpec(props);
|
||||||
|
|
||||||
let widthProp = width ? width : size.width;
|
let widthProp = width ? width : size.width;
|
||||||
if (widthProp < 20) {
|
if (widthProp < 20) {
|
||||||
|
@ -82,7 +78,7 @@ export const DistributionChart: React.FC<DistributionChartProps> = ({
|
||||||
data={{ con: shape.value.continuous, dis: shape.value.discrete }}
|
data={{ con: shape.value.continuous, dis: shape.value.discrete }}
|
||||||
width={widthProp - 10}
|
width={widthProp - 10}
|
||||||
height={height}
|
height={height}
|
||||||
actions={false}
|
actions={actions}
|
||||||
/>
|
/>
|
||||||
) : (
|
) : (
|
||||||
<ErrorAlert heading="Log Domain Error">
|
<ErrorAlert heading="Log Domain Error">
|
||||||
|
@ -116,16 +112,6 @@ export const DistributionChart: React.FC<DistributionChartProps> = ({
|
||||||
return sized;
|
return sized;
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
function buildVegaSpec(isLogX: boolean, isExpY: boolean): VisualizationSpec {
|
|
||||||
return {
|
|
||||||
...chartSpecification,
|
|
||||||
scales: [
|
|
||||||
isLogX ? logXScale : linearXScale,
|
|
||||||
isExpY ? expYScale : linearYScale,
|
|
||||||
],
|
|
||||||
} as VisualizationSpec;
|
|
||||||
}
|
|
||||||
|
|
||||||
interface CheckBoxProps {
|
interface CheckBoxProps {
|
||||||
label: string;
|
label: string;
|
||||||
onChange: (x: boolean) => void;
|
onChange: (x: boolean) => void;
|
||||||
|
|
|
@ -41,6 +41,18 @@ export interface SquiggleChartProps {
|
||||||
logX?: boolean;
|
logX?: boolean;
|
||||||
/** Set the y scale to be exponential by deault */
|
/** Set the y scale to be exponential by deault */
|
||||||
expY?: boolean;
|
expY?: boolean;
|
||||||
|
/** How to format numbers on the x axis */
|
||||||
|
tickFormat?: string;
|
||||||
|
/** Title of the graphed distribution */
|
||||||
|
title?: string;
|
||||||
|
/** Color of the graphed distribution */
|
||||||
|
color?: string;
|
||||||
|
/** Specify the lower bound of the x scale */
|
||||||
|
minX?: number;
|
||||||
|
/** Specify the upper bound of the x scale */
|
||||||
|
maxX?: number;
|
||||||
|
/** Whether to show vega actions to the user, so they can copy the chart spec */
|
||||||
|
distributionChartActions?: boolean;
|
||||||
}
|
}
|
||||||
|
|
||||||
const defaultOnChange = () => {};
|
const defaultOnChange = () => {};
|
||||||
|
@ -60,6 +72,12 @@ export const SquiggleChart: React.FC<SquiggleChartProps> = ({
|
||||||
logX = false,
|
logX = false,
|
||||||
expY = false,
|
expY = false,
|
||||||
chartSettings = defaultChartSettings,
|
chartSettings = defaultChartSettings,
|
||||||
|
tickFormat,
|
||||||
|
minX,
|
||||||
|
maxX,
|
||||||
|
color,
|
||||||
|
title,
|
||||||
|
distributionChartActions,
|
||||||
}) => {
|
}) => {
|
||||||
const { result } = useSquiggle({
|
const { result } = useSquiggle({
|
||||||
code: squiggleString,
|
code: squiggleString,
|
||||||
|
@ -78,6 +96,12 @@ export const SquiggleChart: React.FC<SquiggleChartProps> = ({
|
||||||
showSummary,
|
showSummary,
|
||||||
logX,
|
logX,
|
||||||
expY,
|
expY,
|
||||||
|
format: tickFormat,
|
||||||
|
minX,
|
||||||
|
maxX,
|
||||||
|
color,
|
||||||
|
title,
|
||||||
|
actions: distributionChartActions,
|
||||||
};
|
};
|
||||||
|
|
||||||
return (
|
return (
|
||||||
|
|
256
packages/components/src/lib/distributionSpecBuilder.ts
Normal file
256
packages/components/src/lib/distributionSpecBuilder.ts
Normal file
|
@ -0,0 +1,256 @@
|
||||||
|
import { VisualizationSpec } from "react-vega";
|
||||||
|
import type { LogScale, LinearScale, PowScale } from "vega";
|
||||||
|
|
||||||
|
export type DistributionChartSpecOptions = {
|
||||||
|
/** Set the x scale to be logarithmic by deault */
|
||||||
|
logX: boolean;
|
||||||
|
/** Set the y scale to be exponential by deault */
|
||||||
|
expY: boolean;
|
||||||
|
/** The minimum x coordinate shown on the chart */
|
||||||
|
minX?: number;
|
||||||
|
/** The maximum x coordinate shown on the chart */
|
||||||
|
maxX?: number;
|
||||||
|
/** The color of the chart */
|
||||||
|
color?: string;
|
||||||
|
/** The title of the chart */
|
||||||
|
title?: string;
|
||||||
|
/** The formatting of the ticks */
|
||||||
|
format?: string;
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
export let linearXScale: LinearScale = {
|
||||||
|
name: "xscale",
|
||||||
|
clamp: true,
|
||||||
|
type: "linear",
|
||||||
|
range: "width",
|
||||||
|
zero: false,
|
||||||
|
nice: false,
|
||||||
|
domain: {
|
||||||
|
fields: [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
data: "con",
|
||||||
|
field: "x",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
data: "dis",
|
||||||
|
field: "x",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
||||||
|
},
|
||||||
|
};
|
||||||
|
export let linearYScale: LinearScale = {
|
||||||
|
name: "yscale",
|
||||||
|
type: "linear",
|
||||||
|
range: "height",
|
||||||
|
zero: false,
|
||||||
|
domain: {
|
||||||
|
fields: [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
data: "con",
|
||||||
|
field: "y",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
data: "dis",
|
||||||
|
field: "y",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
||||||
|
},
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
export let logXScale: LogScale = {
|
||||||
|
name: "xscale",
|
||||||
|
type: "log",
|
||||||
|
range: "width",
|
||||||
|
zero: false,
|
||||||
|
base: 10,
|
||||||
|
nice: false,
|
||||||
|
clamp: true,
|
||||||
|
domain: {
|
||||||
|
fields: [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
data: "con",
|
||||||
|
field: "x",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
data: "dis",
|
||||||
|
field: "x",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
||||||
|
},
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
export let expYScale: PowScale = {
|
||||||
|
name: "yscale",
|
||||||
|
type: "pow",
|
||||||
|
exponent: 0.1,
|
||||||
|
range: "height",
|
||||||
|
zero: false,
|
||||||
|
nice: false,
|
||||||
|
domain: {
|
||||||
|
fields: [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
data: "con",
|
||||||
|
field: "y",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
data: "dis",
|
||||||
|
field: "y",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
||||||
|
},
|
||||||
|
};
|
||||||
|
|
||||||
|
export function buildVegaSpec(
|
||||||
|
specOptions: DistributionChartSpecOptions
|
||||||
|
): VisualizationSpec {
|
||||||
|
let {
|
||||||
|
format = ".9~s",
|
||||||
|
color = "#739ECC",
|
||||||
|
title,
|
||||||
|
minX,
|
||||||
|
maxX,
|
||||||
|
logX,
|
||||||
|
expY,
|
||||||
|
} = specOptions;
|
||||||
|
|
||||||
|
let xScale = logX ? logXScale : linearXScale;
|
||||||
|
if (minX !== undefined) {
|
||||||
|
xScale = { ...xScale, domainMin: minX };
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
if (maxX !== undefined) {
|
||||||
|
xScale = { ...xScale, domainMax: maxX };
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
let spec: VisualizationSpec = {
|
||||||
|
$schema: "https://vega.github.io/schema/vega/v5.json",
|
||||||
|
description: "A basic area chart example",
|
||||||
|
width: 500,
|
||||||
|
height: 100,
|
||||||
|
padding: 5,
|
||||||
|
data: [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
name: "con",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
name: "dis",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
||||||
|
signals: [],
|
||||||
|
scales: [xScale, expY ? expYScale : linearYScale],
|
||||||
|
axes: [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
orient: "bottom",
|
||||||
|
scale: "xscale",
|
||||||
|
labelColor: "#727d93",
|
||||||
|
tickColor: "#fff",
|
||||||
|
tickOpacity: 0.0,
|
||||||
|
domainColor: "#fff",
|
||||||
|
domainOpacity: 0.0,
|
||||||
|
format: format,
|
||||||
|
tickCount: 10,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
||||||
|
marks: [
|
||||||
|
{
|
||||||
|
type: "area",
|
||||||
|
from: {
|
||||||
|
data: "con",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
encode: {
|
||||||
|
update: {
|
||||||
|
interpolate: { value: "linear" },
|
||||||
|
x: {
|
||||||
|
scale: "xscale",
|
||||||
|
field: "x",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
y: {
|
||||||
|
scale: "yscale",
|
||||||
|
field: "y",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
y2: {
|
||||||
|
scale: "yscale",
|
||||||
|
value: 0,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
fill: {
|
||||||
|
value: color,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
fillOpacity: {
|
||||||
|
value: 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
type: "rect",
|
||||||
|
from: {
|
||||||
|
data: "dis",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
encode: {
|
||||||
|
enter: {
|
||||||
|
width: {
|
||||||
|
value: 1,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
update: {
|
||||||
|
x: {
|
||||||
|
scale: "xscale",
|
||||||
|
field: "x",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
y: {
|
||||||
|
scale: "yscale",
|
||||||
|
field: "y",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
y2: {
|
||||||
|
scale: "yscale",
|
||||||
|
value: 0,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
fill: {
|
||||||
|
value: "#2f65a7",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
type: "symbol",
|
||||||
|
from: {
|
||||||
|
data: "dis",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
encode: {
|
||||||
|
enter: {
|
||||||
|
shape: {
|
||||||
|
value: "circle",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
size: [{ value: 100 }],
|
||||||
|
tooltip: {
|
||||||
|
signal: "datum.y",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
update: {
|
||||||
|
x: {
|
||||||
|
scale: "xscale",
|
||||||
|
field: "x",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
y: {
|
||||||
|
scale: "yscale",
|
||||||
|
field: "y",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
fill: {
|
||||||
|
value: "#1e4577",
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
},
|
||||||
|
],
|
||||||
|
};
|
||||||
|
if (title) {
|
||||||
|
spec = {
|
||||||
|
...spec,
|
||||||
|
title: {
|
||||||
|
text: title,
|
||||||
|
},
|
||||||
|
};
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
return spec;
|
||||||
|
}
|
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